当館は、鹿児島市の市政施行100周年記念事業の一環で、図書館との複合施設として建設され、平成2年12月に開館しました。
平成24年9月より2階エントランスから4階展示場までの全てで改修工事を行い、地震シュミレーター、環境体験装置、実験ショーを行う「科学劇場」、子どもから大人まで科学工作を体験できる「だれでも工房」など参加体験型の設備が充実され、展示場が新しく生まれ変わります。
5階・6階は宇宙劇場となっており、直径23mの大型ドームスクリーンに映し出されるオムニマックス映画は、3ヶ月ごとに番組を更新し、臨場感あふれる映像で迫力満点です。プラネタリウムでは星空の解説と季節ごとにテーマを変えた番組を投影しています。
※平成24年9月3日から平成25年3月下旬まで更新工事のため、展示場を閉鎖。宇宙劇場は上映。平成25年3月下旬に新展示物でリニューアルオープン。